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Il mwawSimilarity Matrix of Proteins (SIMAP) è un mwbadatabase pubblico che archivia dati sulle sequenze mwbqproteiche ed utilizza il mwbgcalcolo distribuito per rilevarne le somiglianze.

Utilizza il mwcaBerkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) come piattaforma per il calcolo distribuito. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014.

• Obiettivi del progetto

• Software

• Voci correlate

• Collegamenti esterni

Il database del SIMAP è continuamente aggiornato e memorizza tutte le proteine conosciute. Di tutte le proteine esistenti solo una parte è stata studiata abbastanza da scoprirne la funzione. L'idea parte dall'assunto che proteine simili probabilmente hanno funzioni simili. Attraverso quindi il database del SIMAP sarebbe possibile approfondire il comportamento delle proteine simili a quelle più "importanti" come ad esempio quelle relative a malattie o medicinali.

Donando potenza di calcolo al SIMAP si contribuisce all'ampliamento e all'aggiornamento del database.

Simap è sviluppato da Mathias Walter e Michael Böhme studenti di mwdwbioinformatica.

Esistono binari precompilati specifici per sistema operativo e architettura. I mweqsistemi operativi supportati sono: mwegGNU/Linux, mwewMicrosoft Windows, mwfaFreeBSD, mwfqHP-UX, mwfgSolaris (sistema operativo), mwfwNetBSD.

Esistono binari differenti sia per mwgqIA-32 che mwggIA-64.

Il software è ottimizzato per i processori: PARSIC, mwhaSUN mwhqUltraSparc, tutti i processori mwhgAMD ed mwhwIntel.

L'ultima versione di simap per linux è la 5.11 pubblicata il 17 luglio mwiq2006.

• mwjqLista dei progetti di calcolo distribuito

• mwkq(EN) Sito ufficiale, su boincsimap.org. URL consultato il 17 ottobre 2011 (archiviato dall'url originale il 22 gennaio 2011).

• mwkw(EN) mwlaDescrizione dettagliata del progetto al MIPS